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施绍萍简介

作者:    来源:     点击数:       时间:2018-01-14     【打印文章】


个人简历

施绍萍,女,博士,副教授,硕士研究生导师。19967月南昌大学数学专业本科毕业;20027月南昌大学应用数学硕士研究生毕业,同年留校任教;20127月南昌大学生物信息学博士研究生毕业,获博士学位。电子邮箱:shishaoping@ncu.edu.cn。本人主要从事多目标规划,蛋白质结构与功能理论预测、信息挖掘、网络分析等生物信息学方面的研究。近年来,主持完成国家自然科学青年基金和江西省自然科学基金1项,主持在研国家自然科学地区基金1。在多目标规划和生物信息学方面取得了较好的研究成果,构建了一系列蛋白质结构、功能的预测模型,并同步开发了在线预测分析服务平台。在国内数学权威核心期刊《应用数学学报》和国际重要学术期刊 BBA-Molecular Cell ResearchBioinformaticsJournal of Molecular Graphics and ModellingJournal of Chemical Information and ModelingJournal of Theoretical Biology等发表SCI论文20余篇。担任BMC GenomicsPLoS ONEGenomics, Proteomics & Bioinformatics等国际知名期刊审稿人。

 

科研成果

近五年承担科研项目:

1.        国家自然科学基金地区项目:甲基转移酶特异蛋白甲基化识别及其调控网络生物信息挖掘(21665016)40万,2017.1-2020.12,主持,在研。

2.        国家自然科学基金青年项目:氨基酸突变对赖氨酸翻译后修饰影响的生物信息学研究(21305062)25万,2014.1-2016.12,主持,已结题。

3.   江西省自然科学基金项目:亚细胞定位功能预测及在线共享平台创建研究(20151BAB203022)5万,2015.1-2017.12,主持,已结题。

近五年代表性论文:

1.          Lina Wang, Shaoping Shi, Pingping Wen, Zhiyou Zhou, Jianding Qiu*. Computing prediction and functional analysis of prokaryotic propionylation, Journal of Chemical Information and Modeling, 2017, 57(11), 2896-2904.

2.          Lina Wang, Shaoping Shi, Haodong Xu, Pingping Wen, Jianding Qiu*. Computational prediction of species-specific malonylation sites via enhanced characteristic strategy, Bioinformatics, 2017, 33(10), 1457-1463.

3.          PingpingWen, Shaoping Shi, Haodong Xu, Lina Wang, Jianding Qiu*. Accurate in silico prediction of species-specific methylation sites based on information gain feature optimization, Bioinformatics, 2016, 32(20), 3107-3115.

4.          Xiang Chen, Shaoping Shi, Haodong Xu, Shengbao Suo, Jianding Qiu*. A homology-based pipeline for global prediction of post-translational modification sites, Scientific Reports, 2016, 6, 25801.

5.          Shaoping Shi, Haodong Xu, Pingping Wen, Jianding Qiu*, Progress and challenges in predicting protein methylation sites, Molecular BioSystems, 2015, 11, 2610-2619.

6.          Shaoping Shi, Xiang Chen, Haodong Xu, Jianding Qiu*, PredHydroxy: Computational prediction of protein hydroxylation site locations based on the primary structure, Molecular BioSystems, 2015, 11: 819-825.

7.          Shaoping Shi, Xingyu Sun, Jianding Qiu*, Shengbao Suo, Xiang Chen, Shuyun Huang, Ruping Liang, The prediction of palmitoylation site locations using a multiple feature extraction methods, Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2013, 40: 125-130.

8.          Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, A method to distinguish between lysine acetylation and lysine methylation from protein sequences, Journal of Theoretical Biology, 2012, 310: 223-230.

9.          Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, PMeS: Prediction of methylation sites based on enhanced feature encoding scheme, PLoS ONE, 2012, 7(6): e38772.

10.      Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, PLMLA: Prediction of lysine methylation and lysine acetylation by combining multiple features, Molecular BioSystems, 2012, 8 (5): 1520-1527.


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